HIV undertyper

Humant immunsviktvirus
Vitenskapelig klassifisering
Domene	Riboviria
kongedømme	Pararnavirae
Klasse	Revtraviricetes
Rekkefølge	Ortervirales
Familie	Retroviridae
Underfamilie	Orthoretrovirinae
Sjanger	Lentivirus
Arter	HIV-1 HIV-2

Et av problemene med det humane immunsviktviruset i kliniske omgivelser er dets høye genetiske variasjon . [1]

HIV-virusarten er delt inn i to hovedtyper:

• HIV type 1 (HIV-1), relatert til virus funnet i vestafrikanske sjimpanser og gorillaer ;
• HIV type 2 (HIV-2), relatert til virus funnet i en vestafrikansk primat , Cercocebo moro .

HIV-1-virus kan videre deles inn i grupper, hvorav HIV-1-virusgruppen M er den dominerende blant mennesker og er ansvarlig for AIDS - pandemier . Gruppe M kan igjen deles inn i undertyper basert på ulik genetisk informasjon; basert på disse er det mulig å bestemme graden av virulens av patogenene og eventuell motstand mot antiretroviral terapi.

HIV-2-virus anses generelt for å være mindre virulente og smittsomme enn HIV-1-virus i gruppe M, selv om førstnevnte også er i stand til å forårsake AIDS .

Hovedtyper

Det følgende er ikke en uttømmende liste, og det er svært sannsynlig at andre typer virus vil bli oppdaget og klassifisert i fremtiden. [2]

HIV-1

Svært vanlige og virulente patogener tilskrives HIV-1-gruppen . Det er vanlig å identifisere følgende grupper:

• Gruppe M (hoved), fra M = Major (hoved);
• Gruppe N (minoritet), fra N = ikke (ikke O og ikke P);
• Gruppe O (minoritet), fra O = Outlier (unntak);
• Gruppe P (minoritet), fra P = Venter (venter på omformulering);

Hver HIV-1-gruppe antas å representere en uavhengig overføring av SIV hos mennesker. [3]

Gruppe M

Den store (hoved)gruppen er ansvarlig for over 90 % av HIV /AIDS-tilfellene registrert hos HIV-infiserte pasienter. Innenfor M-gruppen er det "klader", det vil si "undertyper" identifisert med en bokstav i alfabetet. I tillegg kan det være rekombinante varianter , eller "sirkulerende rekombinante former" der to forskjellige undertyper danner et nytt virus, identifisert med et nummer. For eksempel kalles et rekombinant virus dannet av subtype B og F CRF12_BF (Sirkulerende rekombinant form 12 BF, sirkulerende rekombinant form 12 av B og F).

De viktigste undertypene er som følger:

• Subtype A, vanlig i Vest-Afrika . [4]
• Subtype B, dominerende form i Europa , Amerika , Japan og Australia . [5] og mest vanlig i Midtøsten og Nord-Afrika . [6]
• Subtype C, dominerende form i Sør-Afrika , Øst-Afrika , India , Nepal og noen deler av Kina . [5]
• Subtype D, vanligvis bare funnet i det sentrale og østlige Afrika . [5]
• Subtype E, funnet i Sørøst-Asia ; det er den dominerende formen hos heterofile siden overføringsfrekvensen er høyere enn de fleste andre undertyper.
• Subtype F, tilstede i Sentral-Afrika , Sør-Amerika og Øst-Europa . [2]
• Subtype G (sammen med den rekombinante formen med subtype A CRF02_AG) er funnet i Afrika og Sentral-Europa . [2]
• Subtype H, begrenset til Sentral-Afrika . [2]
• (Subtype I), som opprinnelig ble brukt til å beskrive en art som nå er kjent som CRF04_cpx, med cpx som står for rekombinasjons "kompleks" for flere undertyper.
• Subtype J, funnet hovedsakelig i Karibien og Nord- , Sentral- og Vest-Afrika. [7]
• Subtype K er begrenset til Den demokratiske republikken Kongo og Kamerun .

Gruppe N

"N" står for "ikke-M" og "ikke-O". Denne gruppen ble oppdaget i 1998, av en fransk-kamerunsk forskningsgruppe, da de identifiserte og isolerte en annen HIV-1-stamme, YBF380.

YBF380 ble isolert fra en kvinne fra republikken Kamerun som døde av AIDS i 1995. Ved testing in vitro reagerte variant YBF380 med et overflateantigen av SIV-viruset (sjimpanse) i stedet for de fra gruppe M eller gruppe O, noe som tyder på fremveksten av en ny HIV-1-stamme. [8] Per 2015 er det færre enn 20 gruppe N-infeksjoner. [9]

Gruppe O

Outlier-gruppen er ofte registrert i Kamerun og andre regioner i vest-sentral-Afrika. I 1997 ble det hevdet at omtrent 2 % av de som ble smittet i Kamerun var infisert med HIV-1 gruppe O. Denne kliniske undergruppen vakte opprinnelig bekymring i den kliniske settingen, siden dens positivitet ikke ble oppdaget av gamle HIV-1-tester. Nåværende tester er i stand til å oppdage både gruppe O og gruppe N.

Gruppe P

I 2009 ble en ny HIV-sekvens analysert, svært lik SIV som ble oppdaget i noen ville gorillaer (SIVgor) enn den som ble oppdaget hos sjimpanser (SIVcpz). Viruset ble isolert fra en kamerunsk kvinne bosatt i Frankrike , diagnostisert i 2004 med HIV-1-infeksjon. Denne gruppen kalles så ved ventende, det vil si "avventer identifisering av andre menneskelige tilfeller". [10] [11]

HIV-2

HIV-2 er ikke vanlig utenfor Afrika. De første tilfellene av HIV-2 i ikke-afrikanske områder ble registrert i 1987 i USA . [12] I dag er mange sett i stand til å identifisere både HIV-1 og HIV-2. [1. 3]

Fra 2010 er åtte HIV-2-grupper kjent:

• Gruppe A, pandemi , hovedsakelig registrert i Afrika , selv om HIV-2 tilfeller er kjent i Brasil , India , Europa og USA . [14] [15]
• Gruppe B, pandemi , hovedsakelig begrenset til Vest-Afrika . Selv om smitte er begrenset, bør HIV-2-infeksjon mistenkes hos alle pasienter som viser HIV-symptomer og som har hatt kontakt med væske fra en vestafrikansk person (bruk av delte sprøyter, kontaktseksuell, for eksempel). [16]
• Gruppe C og D, funnet i bare to personer fra Liberia ;
• Gruppe E og F, funnet i bare to personer fra Sierra Leone ;
• Gruppe G og H, oppdaget hos bare to personer fra Elfenbenskysten . [14]

For de seks ikke-pandemiske gruppene (C til H) ble deras genom funnet å være svært lik SIVsmm-stammer (fra Cercocebes ) som bodde i det samme området der menneskelig infeksjon ble registrert. [14] [15]

Merknader

1. ^ David L. Robertson, Beatrice H. Hahn og Paul M. Sharp, Recombination in AIDS viruses , i Journal of Molecular Evolution , vol. 40, nei. 3, 1995-03, s. 249-259, DOI : 10.1007 / BF00163230 . Hentet 4. januar 2021 .
2. ^ a b c d HIV-stammer og typer , i AVERT , 16. juli 2015. Hentet 7. juli 2018 .
3. ^ Paul M. Sharp og Beatrice H. Hahn, Origins of HIV and the AIDS pandemic , i Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine , vol. 1, nei. 1, 2011-9, s. a006841, DOI : 10.1101 / cshperspect.a006841 . Hentet 7. juli 2018 .
4. ^ Aleksei F. Bobkov, Elena V. Kazennova og Ludmila M. Selimova, Temporal trends in the HIV-1 epidemic in Russia: predominance of subtype A , i Journal of Medical Virology , vol. 74, n. 2, 2004-10, s. 191–196, DOI : 10.1002 / jmv.20177 . Hentet 7. juli 2018 .
5. ^ a b c Goudsmit, Jaap., Viral Sex; Naturen til AIDS. , i Oxford University Press. New York ,, s. 51-58.
6. ^ Malik Sallam, Gülşen Özkaya Şahin og Mikael Ingman, Genetisk karakterisering av overføring av humant immunsviktvirus type 1 i Midtøsten og Nord-Afrika , i Heliyon , vol. 3, nei. 7, 2017-7, s. e00352, DOI : 10.1016 / j.heliyon.2017.e00352 . Hentet 7. juli 2018 .
7. ^ Joris Hemelaar, Eleanor Gouws og Peter D. Ghys, Global og regional distribusjon av HIV-1 genetiske subtyper og rekombinanter i 2004 , i AIDS (London, England) , vol. 20, nei. 16, 24. oktober 2006, s. W13–23, DOI : 10.1097 / 01.aids.0000247564.73009.bc . Hentet 7. juli 2018 .
8. ^ Thomas Mourez , François Simon og Jean-Christophe Plantier, Non-M Variants of Human Immunodeficiency Virus Type 1 , i Clinical Microbiology Reviews , vol. 26, n. 3, 1. juli 2013, s. 448–461, DOI : 10.1128 / CMR.00012-13 . Hentet 7. juli 2018 .
9. ^ Mirela D'arc, Ahidjo Ayouba og Amandine Esteban, Opprinnelsen til HIV-1 gruppe O-epidemien i vestlige lavlandsgorillaer , i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , vol. 112, n. 11, 17. mars 2015, s. E1343 – E1352, DOI : 10.1073 / pnas.1502022112 . Hentet 7. juli 2018 .
10. ^ Jean-Christophe Plantier, Marie Leoz og Jonathan E. Dickerson, Et nytt humant immunsviktvirus avledet fra gorillaer , i Nature Medicine , vol. 15, nei. 8, 2009-8, s. 871–872, DOI : 10.1038 / nm . 2016 . Hentet 8. juli 2018 .
11. ^ Donald G. McNeil Jr., forløper til HIV var i aper i årtusener, sier studien . Hentet 8. juli 2018 .
12. ^ Hivworkshop.com . Hentet 8. juli 2018 (Arkiveret fra originalen 15. januar 2013) .
13. ^ Senter for biologisk evaluering og forskning, tester for infeksjonssykdommer - komplett liste over donorscreeningsanalyser for smittestoffer og HIV-diagnostiske analyser , på fda.gov . Hentet 8. juli 2018 .
14. ^ a b c Mario L. Santiago, Friederike Range og Brandon F. Keele, Simian immunsviktvirusinfeksjon i frittgående sotede mangabeys (Cercocebus atys atys) fra Taï-skogen, Elfenbenskysten: implikasjoner for opprinnelsen til epidemisk human immunsvikt virus type 2 , i Journal of Virology , vol. 79, n. 19, 2005-10, s. 12515–12527, DOI : 10.1128 / JVI.79.19.12515-12527.2005 . Hentet 8. juli 2018 .
15. ^ a b PA Marx, PG Alcabes og E. Drucker, Seriell menneskelig passasje av simian immunsviktvirus ved usterile injeksjoner og fremveksten av epidemisk humant immunsviktvirus i Afrika , i Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences , vol. 356, n. 1410, 29. juni 2001, s. 911–920, DOI : 10.1098 / rstb.2001.0867 . Hentet 8. juli 2018 .
16. ^ Retningslinjer for behandling av hiv / aids , på AIDSinfo . Hentet 8. juli 2018 .

Eksterne lenker

• ( EN ) HIV-undertyper , i Encyclopedia Britannica , Encyclopædia Britannica, Inc.