Type III-sekresjonssystemet er et proteinvedheng som finnes i flere gramnegative bakterier .
Hos patogene bakterier brukes denne nålestrukturen som en sensorisk sonde for å oppdage tilstedeværelsen av eukaryote organismer og for å skille ut proteiner som hjelper bakteriene å infisere dem . Effektorproteiner skilles ut direkte fra bakteriecellen til den eukaryote (verts) cellen, hvor de utøver en rekke effekter som hjelper patogenet til å overleve og unnslippe en immunrespons .