Synapomorfien (fra det greske σύν , syn = sammen, ἀπό , apo = fra, μορφή , morphe = form) er i kladistikk en avledet karakter , det vil si en ny delt karakter, nyttig for å rekonstruere fylogenetiske trær . Synapomorfier indikerer derfor de egenskapene som organismer presenterer som arvet fra en felles stamfar. Den kladistiske klassifiseringen vurderer bare de vanlige avledede karakterene.
Konseptet synapomorfi ble introdusert i 1966 av Willi Hennig og er et nøkkelbegrep i metodikken for fylogenetisk analyse .
Hver hypotetisk synapomorfi utsettes for en kongruenstest, det vil si at fordelingsmønsteret mellom de ulike taxaene studeres ved å sammenligne det med andre karakterer.