Ligase

I biokjemi er en ligase ( nummer EC 6 [1] - fra det latinske verbet ligāre , "å binde") et enzym som katalyserer bindingen mellom to molekyler for å danne et nytt molekyl med utgangspunkt i de to første, ofte ledsaget av hydrolyse av et molekyl som ATP .

En typisk reaksjon katalysert av en ligase kan skjematiseres som:

A + B → A – B

Nomenklatur

Vanlige navn på proteiner fra denne familien inkluderer ofte begrepet "ligase" (som for DNA-ligase , ofte brukt i laboratoriet for molekylærbiologiske applikasjoner ). Andre begreper som ofte brukes er "syntetase" (disse enzymene brukes faktisk i syntesen av nye molekyler) og det for "karboksylase" (hvis det tilsatte stykket er et karbondioksydmolekyl ).

Det skal bemerkes at begrepet "syntetase" ikke skal forveksles med syntase , siden syntasene ikke bruker ATP eller andre lignende molekyler og tilhører gruppen av lyaser .

Klassifisering

Ligaser er klassifisert som EC 6 i enzymklassifiseringen etter EC-nummer. Ligasene er igjen delt inn i 6 ytterligere underklasser:

• EC 6.1: inkluderer ligaser som brukes til å danne karbon - oksygenbindinger ;
• EC 6.2: inkluderer ligaser som brukes til å danne karbon- svovelbindinger ;
• EC 6.3: inkluderer ligaser som brukes til å danne karbon- nitrogenbindinger ;
• EC 6.4: inkluderer ligaser som brukes til å danne karbon-karbonbindinger;
• EC 6.5: inkluderer ligaser som brukes til å danne fosfodiesterbindinger ;
• EC 6.6: Inkluderer ligaser som brukes til å danne nitrogen -metallbindinger .

Merknader

1. ^ 6 , i ExplorEnz - The Enzyme Database , IUBMB .

Relaterte elementer

• DNA-ligase
• EC klassifisering
• Hydrolase
• Isomerase
• Lyiasis
• Oksidoreduktase
• Transferasis

Eksterne lenker

• ( EN ) Introduksjon om EC 6-proteiner fra Institutt for kjemi ved Queen Mary University of London , på chem.qmul.ac.uk. Hentet 29. april 2006 (arkivert fra originalen 16. august 2011) .
• ( NO ) IUPAC Gold Book, "ligases (synthetases)" , på goldbook.iupac.org .